在商业活动中，财务管理的专业性至关重要。尤其是在上海这样的大都市，代理记账公司的服务质量直接影响到企业的运营成本和合规性。如果发现上海代理记账公司的账目处理不专业，以下是一些应对策略。

1. 评估问题严重性

需要明确账目处理不专业的具体表现。是简单的错误，还是严重的违规行为？了解问题的严重性有助于决定下一步的行动。

2. 与代理记账公司沟通

与代理记账公司进行沟通，表达你的担忧和期望。询问他们是否意识到问题，并探讨可能的解决方案。

3. 寻求内部解决方案

如果代理记账公司愿意合作，可以要求他们提供详细的账目处理流程，并对存在的问题进行整改。内部加强财务人员的培训，提高财务处理的专业性。

4. 外部专业咨询

如果内部解决困难，可以考虑寻求外部专业机构的帮助。他们可以提供专业的财务审计和咨询服务，帮助找出问题根源并给出改进建议。

5. 考虑更换代理记账公司

如果代理记账公司的服务质量长期不达标，可以考虑更换合作伙伴。在更换前，确保新公司具备专业的财务处理能力和良好的信誉。

6. 加强内部监管

建立严格的内部监管机制，确保财务数据的准确性和合规性。定期对账目进行审核，及时发现和处理问题。

7. 法律途径

如果代理记账公司的行为涉嫌违法，可以通过法律途径维护自己的权益。咨询专业律师，了解自己的权利和可能的法律行动。

8. 预防措施

为了避免未来再次出现类似问题，可以采取以下预防措施：

- 选择有良好口碑和资质的代理记账公司；

- 定期对账目进行审计；

- 加强财务人员的专业培训；

- 建立健全的财务管理制度。