随着中国市场的不断扩大，越来越多的外资公司选择在上海设立分支机构。为了确保这些公司在中国的税务合规，进行税务合规检查显得尤为重要。本文将详细介绍外资公司在上海申报税时如何进行税务合规检查。

一、了解中国税法及政策

1. 学习相关法律法规：外资公司首先需要了解中国的税法体系，包括《中华人民共和国企业所得税法》、《中华人民共和国增值税法》等，以及相关的实施细则和通知。

2. 关注政策动态：税法政策会随着经济形势的变化而调整，外资公司应密切关注相关政策动态，确保申报的准确性。

3. 咨询专业机构：如需深入了解，可咨询专业的税务顾问或律师，获取最新的政策解读。

二、梳理公司税务情况

1. 审查会计账簿：检查公司会计账簿的完整性和准确性，确保所有交易都已正确记录。

2. 核对税务申报表：对比税务申报表与会计账簿，确保申报数据的真实性。

3. 审查发票管理：检查发票的开具、保管和使用是否符合规定。

三、识别税务风险点

1. 收入确认：检查收入确认是否符合税法规定，避免提前确认收入或延迟确认收入。

2. 成本费用：审查成本费用的合理性，避免虚列成本或费用。

3. 税收优惠：了解公司是否符合享受税收优惠的条件，确保及时申报。

四、制定税务合规计划

1. 风险评估：根据公司业务特点和税务风险点，进行风险评估。

2. 制定合规措施：针对识别出的风险点，制定相应的合规措施。

3. 实施监控：对合规措施的实施情况进行监控，确保其有效性。

五、执行税务合规措施

1. 加强内部控制：建立健全内部控制制度，确保税务申报的准确性。

2. 培训员工：对员工进行税务知识培训，提高员工的税务意识。

3. 定期自查：定期对税务合规情况进行自查，及时发现和纠正问题。

六、应对税务检查

1. 积极配合：在税务检查过程中，积极配合税务机关的工作。

2. 提供资料：按照要求提供相关资料，确保检查的顺利进行。

3. 沟通协调：与税务机关保持良好沟通，及时解决检查过程中出现的问题。

七、总结与改进

1. 总结经验：在税务合规检查结束后，总结经验教训，为今后的税务合规工作提供参考。

2. 持续改进：根据检查结果，对税务合规措施进行改进，提高公司的税务管理水平。