本文旨在探讨上海企业在完成清算审计后如何处理税务争议。文章从税务争议的识别、沟通协调、法律咨询、税务调整、税务争议解决机制以及后续税务管理等方面进行详细阐述，旨在为企业提供解决税务争议的实用指南。

一、税务争议的识别

1. 审计报告分析：企业在清算审计完成后，首先要对审计报告进行仔细分析，识别报告中可能存在的税务争议点。这包括对审计意见、调整事项的深入理解。

2. 内部审查：企业内部应设立专门的税务审查小组，对审计报告中的税务问题进行内部审查，确保所有争议点都被识别出来。

3. 专业咨询：如遇复杂或专业性较强的税务问题，企业可以寻求专业税务顾问的帮助，以准确识别税务争议。

二、沟通协调

1. 与税务机关沟通：企业应主动与税务机关沟通，说明审计中发现的问题，寻求税务机关的理解和支持。

2. 内部协调：企业内部各部门之间应加强协调，确保税务争议处理的一致性和效率。

3. 第三方调解：在必要时，可以寻求第三方调解机构介入，以中立的身份协助解决税务争议。

三、法律咨询

1. 专业律师团队：企业应组建或聘请专业律师团队，对税务争议进行法律咨询，确保争议处理的合法性和合规性。

2. 法律文件准备：律师团队应协助企业准备相关法律文件，包括但不限于申诉书、答辩状等。

3. 法律风险评估：律师团队应对税务争议的法律风险进行全面评估，为企业提供风险控制建议。

四、税务调整

1. 调整方案制定：根据审计报告和律师团队的建议，企业应制定合理的税务调整方案。

2. 调整实施：按照调整方案，企业应积极实施税务调整，确保税务争议得到妥善解决。

3. 调整效果评估：税务调整完成后，企业应对调整效果进行评估，确保调整达到预期目标。

五、税务争议解决机制

1. 协商解决：企业应积极与税务机关协商，寻求双方都能接受的解决方案。

2. 行政救济：如协商无果，企业可以通过行政救济途径，如行政复议、行政诉讼等，寻求税务争议的解决。

3. 国际税务争议解决：对于涉及国际税务争议的情况，企业可以寻求国际税务争议解决机制的帮助。

六、后续税务管理

1. 完善税务管理制度：企业应完善税务管理制度，从源头上预防税务争议的发生。

2. 加强税务培训：企业应加强对员工的税务培训，提高员工的税务意识和合规能力。

3. 定期税务审计：企业应定期进行税务审计，及时发现和解决潜在的税务问题。

上海企业在清算审计后处理税务争议，需要从多个方面进行综合考虑。通过识别争议、沟通协调、法律咨询、税务调整、税务争议解决机制以及后续税务管理，企业可以有效地解决税务争议，确保税务合规。