一、小了解特殊业务类型

在处理上海公司的做账报税时，首先需要明确特殊业务的具体类型。特殊业务可能包括但不限于以下几种：

1. 关联交易

2. 外币业务

3. 研发费用加计扣除

4. 资产损失税前扣除

5. 特种行业税收优惠

6. 国际税收协定应用

7. 股权激励计划

二、小关联交易处理

关联交易是指企业与其关联方之间的交易。处理关联交易时，应注意以下几点：

1. 确保关联交易的公允性，避免税务风险。

2. 按照税法规定，提供关联交易的定价方法、定价依据等资料。

3. 对关联交易进行合理分摊，确保税负公平。

4. 定期进行关联交易申报，接受税务机关的审核。

5. 如有争议，及时与税务机关沟通，寻求解决方案。

三、小外币业务处理

外币业务在处理时，需要注意以下几点：

1. 按照国家外汇管理局的规定，正确核算外币业务。

2. 及时进行外币折算，确保财务报表的准确性。

3. 对外币业务产生的汇兑损益进行合理处理。

4. 按照税法规定，申报外币业务相关税收。

5. 定期进行外币业务审计，确保合规。

四、小研发费用加计扣除

研发费用加计扣除是鼓励企业进行科技创新的重要政策。处理研发费用加计扣除时，应注意以下几点：

1. 确保研发费用的真实性和合理性。

2. 按照税法规定，准确计算研发费用加计扣除额度。

3. 及时进行研发费用加计扣除申报。

4. 如有疑问，及时咨询税务机关。

5. 定期进行研发费用加计扣除审计。

五、小资产损失税前扣除

资产损失税前扣除是指企业在生产经营过程中，因自然灾害、意外事故等原因造成的资产损失。处理资产损失税前扣除时，应注意以下几点：

1. 确保资产损失的合法性和真实性。

2. 按照税法规定，准确计算资产损失税前扣除额度。

3. 及时进行资产损失税前扣除申报。

4. 如有疑问，及时咨询税务机关。

5. 定期进行资产损失税前扣除审计。

六、小特种行业税收优惠

特种行业税收优惠是指针对特定行业或企业的税收优惠政策。处理特种行业税收优惠时，应注意以下几点：

1. 确保企业符合特种行业税收优惠条件。

2. 按照税法规定，准确享受特种行业税收优惠。

3. 及时进行特种行业税收优惠申报。

4. 如有疑问，及时咨询税务机关。

5. 定期进行特种行业税收优惠审计。

七、小国际税收协定应用

国际税收协定是企业进行跨国经营时的重要依据。处理国际税收协定应用时，应注意以下几点：

1. 确保企业符合国际税收协定适用条件。

2. 按照税法规定，正确应用国际税收协定。

3. 及时进行国际税收协定申报。

4. 如有疑问，及时咨询税务机关。

5. 定期进行国际税收协定审计。